É conhecido que raros antibióticos podem, raramente, provocar diarréias graves e persistentes. Tais sintomas fazem pensar na possibilidade de uma colite pseudomembranosa, que deverá ser diagnosticada através de colonoscopia. Nestes casos será preciso suspender imediatamente a terapia c/ CEFOTAX e iniciar o tratamento por via oral c/ vancomicina, estando contra-indicados os preparados antiperistálticos. Nas doses recomendadas e utilizadas habitualmente não são observados outros efeitos colaterais significativos, c/ exceção de possíveis reações alérgicas devido a hipersensibilidade à cefalosporina.