Glucoformin 500 é geralmente bem tolerado. Foram descritos alguns casos de intolerância digestiva (náuseas, vômitos, diarréia) durante os primeiros dias de tratamento, embora de caráter leve e que não exigiram a interrupção da medicação. Estes efeitos secundários costumam desaparecer tomando-se o medicamento durante ou logo após a ingestão de alimentos. Ocasionalmente foram observadas reações cutâneas e gosto metálico. A metformina reduz a absorção da vitamina B12.