A furazolidona, é bem tolerado nas doses recomendadas, tendo sido relatados raros casos de hipersensibilidade cutânea, hipotensão, febre ou artralgia, que cederam prontamente à suspensão do tratamento. Foram também referidos episódios de náusea, vômitos, cefaléia e mal-estar, sempre reversíveis. Muito raramente observou-se reação tipo dissulfiram, ao associar-se bebidas alcoólicas. Em pequeno percentual de grupos étnicos particulares, com defeito intrínseco do metabolismo dos eritrócitos, a furazolidona e outros medicamentos podem provocar hemólise intravascular, de grau leve e reversível. O cloridrato de difenoxilato pode provocar reações adversas ao nível do sistema nervoso central, tais como: depressão, euforia, sedação, confusão mental, tonteira, cefaléia, agitação; no sistema gastrointestinal, como náusea, vômito, anorexia, íleo paralítico, megacólon tóxico, pancreatite; e reações alérgicas, como prurido, urticária, edema angioneurótico, anafilaxia. As reações de caráter grave são raras.