O fluconazol 150 mg geralmente é bem tolerado.
Em alguns pacientes, especialmente naqueles com doenças subjacentes sérias, como portadores do vírus HIV e câncer, foram observadas alterações na função renal e hematológica e anormalidades hepáticas (vide item 5. Advertências e Precauções) durante o tratamento com fluconazol e agentes comparativos, mas a significância clínica e a relação com o tratamento são incertas.
Os seguintes efeitos indesejáveis foram observados e relatados durante o tratamento com fluconazol com as seguintes frequências: muito comum (=> 1/10); comum (=> 1/100 a <1/10); incomum (=> 1/1.000 a <1/100); rara (=> 1/10.000 a <1/1.000); muito rara (<1/10.000); desconhecida (não pode ser estimada a partir dos dados disponíveis).
| Classe de Sistema de Órgão | Frequência | Reações Adversas |
| Distúrbios do sangue e sistema linfático | rara | agranulocitose leucopenia, neutropenia,trombocitopenia |
| Distúrbios do sistema imunológico | rara | anafilaxia, angioedema |
| Distúrbios metabólicos e nutricionais | rara | hipertrigliceridemia, hipercolesterolemia,hipocalemia |
| Distúrbios psiquiátricos | incomum | insônia, sonolência |
| comum | cefaleia | |
| Distúrbios do sistema nervoso | incomum | convulsões tontura, parestesia, alteração do sabor |
| rara | tremores | |
| Distúrbios auditivos e do labirinto | incomum | vertigem |
| Distúrbios cardíacos | rara | torsade de pointes, prolongamento QT |
| Distúrbios gastrintestinais | comum | dor abdominal, diarreia, náuseas, vômitos |
| incomum | dispepsia, flatulência, boca seca | |
| Distúrbios hepatobiliares | comum | aumento da alanina aminotransferase, aumento da aspartatoaminotransferase, aumento da fosfatase alcalina sanguínea |
| incomum | colestase, icterícia, aumento da bilirrubina | |
| rara | toxicidade hepática, incluindo casos raros de fatalidades,insuficiência hepática, necrose hepatocelular, hepatite, danoshepatocelulares | |
| Distúrbios da pele e tecido subcutâneo | comum | rash cutâneo |
| incomum | prurido, urticária, aumento da sudorese, erupção | |
| rara | necdriólise epidérmica tóxica,síndrome de Stevens-Johnson, pustulose exantematosageneralizada aguda, dermatite esfoliativa, edema facial, alopecia | |
| não conhecida | reação ao medicamento com eosinofilia e sintomas sistêmicos(DRESS) | |
| Distúrbios musculoesqueléticos, do tecidoconjuntivo | incomum | mialgia |
| Distúrbios gerais e condições no local deadministração | incomum | fadiga, mal-estar, astenia, febre |