A administração concomitante de ciprofloxacino e teofilina pode produzir aumento indesejável das concentrações séricas de teofilina. Quando o uso de ambos for inevitável, as concentrações séricas de teofilina deverão ser cuidadosamente monitoradas, para o ajuste de sua dose. Nos casos em que isso não seja possível, a teofilina deverá ter sua dose reduzida à metade da indicada. Esse ajuste, que deverá ser feito antes da administração da 1ª dose de ciprofloxacino, evita as altas concentrações sérias de teofilina comumente observadas e que provocam efeitos colaterais graves, como arritmias ventriculares, convulsões, etc.
A administração simultânea de ciprofloxacino com a ciclosporina pode causar aumento transitório de creatinina sérica. Portanto, é necessário controlar a concentração de creatinina sérica nesses pacientes.