Dor passageira, desconforto e tumefação da gengiva podem ocorrer durante os primeiros dias após a inserção do chip, devido à colocação mecânica do mesmo na bolsa periodontal. A dor pode ser aliviada pela administração de analgésicos como paracetamol 500 mg ou ibuprofeno 200-400 mg. Se necessário, pode-se tomar outra dose após 4 horas. Reações adversas características do bochecho com soluções de clorexidina, como manchamento dos dentes, alteração no paladar e irritação na boca não são esperadas no tratamento com PERIOCHIP (gliconato de clorexidina), já que o contato possível com a mucosa oral e gengiva é mínimo.