A amitriptilina é contra-indicada em pacientes que mostraram prévia sensibilidade à substância. Não deve ser administrada simultaneamente com inibidores da monoaminoxidase; têm ocorrido crises hiperpiréticas, convulsões graves e morte em pacientes que receberam simultaneamente antidepressivos tricíclicos e medicamentos inibidores da monoaminoxidase. Este medicamento não é recomendado para uso durante a fase de recuperação aguda após infarto do miocárdio ou falência cardíaca. Não deve ser usado na vigência de glaucoma agudo, retenção urinária por afecção prostática e insuficiência hepática ou renal graves.