As observações clínicas não revelaram qualquer dano fetal como se poderia prever a partir dos resultados da experimentação animal. Mesmo assim, o Fansidar (Sulfadoxina + Pirimetamina) não deve ser administrado no início da gravidez ou a mulheres nas quais não se pode afastar com segurança o risco de gravidez, a não ser nos casos de absoluta necessidade.
Fansidar (Sulfadoxina + Pirimetamina) não deve ser administrado a mulheres que estão amamentando. Caso seja necessário, deve-se interromper a alimentação ao seio. O Fansidar (Sulfadoxina + Pirimetamina) não deve ser administrado a crianças com menos de 2 meses de vida.