O isoflurano aumenta consideravelmente o fluxo sanguíneo cerebral, com aumento transitório da pressão do líquor, que é totalmente reversível com hiperventilação.
Como os níveis de anestesia podem sofrer modificações com muita facilidade e rapidez, devem ser utilizados unicamente vaporizadores que proporcionem concentrações previsíveis e com precisão adequada, como os do tipo "flow-through" construidos e especialmente calibrados para o isoflurano. Observam-se aumento na hipotensão e depressão respiratória à medida que se aprofunda a anestesia.
Em comparação com o halotano, tem-se observado aumento da perda de sangue em pacientes com aborto.
TODOS OS RELAXANTES MUSCULARES CORRENTES SÃO NOTAVELMENTE POTENCIALIZADOS PELO ISOFLURANO; NÃO OBSTANTE, O EFEITO TEM SIDO PROFUNDAMENTE MARCANTE COM OS RELAXANTES NÃO DESPOLARIZANTES.