fluconazol é geralmente bem tolerado. Os efeitos colaterais comuns estão relacionados ao aparelho gastrintestinal e incluem náuseas, vômitos, dores abdominais, diarréia e flatulência; erupção cutânea, cefaléia, astenia e tonturas e alterações das enzimas hepáticas. Reações imunológicas, principalmente anafilaxia, foram raramente relatadas. Algumas reações, tais como: distúrbios hepáticos, dermatológicos, hematopoiéticos e linfáticos (leucopenia, trombocitopenia) foram relatados e ainda não há evidências conclusivas de que estejam relacionados a associações.