A genfibrozila é contraindicada a pacientes com disfunção hepática ou disfunção renal grave, problemas na vesícula biliar pré- existentes e no caso de hipersensibilidade à genfibrozila ou a qualquer componente da fórmula.
O uso concomitante de genfibrozila com repaglinida também é contraindicado. Não deve ser feito uso concomitante de genfibrozila com outros reguladores de lípides, como os inibidores da HMG-CoA redutase (como sinvastatina, lovastatina, atorvastatina e rosuvastatina) (vide item 5. Advertências e Precauções e item 6. Interações Medicamentosas).