BACFAR® não deve ser utilizado em pacientes com doença grave no fígado e no rim quando não se puder determinar regularmente a concentração da droga no sangue.
BACFAR® também está contraindicado aos pacientes com alergia à sulfonamida ou à trimetoprima.
BACFAR® não deve ser administrado a prematuros e recém-nascidos durante as primeiras 6 semanas de vida. BACFAR® não deve ser utilizado por pacientes com sérias alterações hematológicas (no sangue) nem a pacientes portadores de deficiência de G6PD (desidrogenase de glicose 6- fosfato), a não ser em casos de absoluta necessidade e em doses mínimas.