PYR-PAM® é um fármaco bem tolerado, apresentando baixa incidência de efeitos colaterais. Geralmente, os efeitos adversos são leves e transitórios. Ocasionalmente, pode ocorrer náusea, vômito, cólica gastrintestinal, diarréia. Raras vezes foram relatados casos de reações de hipersensibilidade e fotossensibilidade de curta duração. Devido à característica específica do pamoato de pirvínio, a administração do fármaco causa coloração vermelha das fezes, não tendo significância clínica.