Drogas indutoras enzimáticas, tais como: rifampicina e fenitoína reduzem significativamente a biodisponibilidade oral de itraconazol. Consequentemente, monitorização de concentrações plasmáticas de itraconazol é aconselhável quando estes agentes indutores enzimáticos são co-administrados. Como o itraconazol é metabolizado principalmente pela CYP3A4, os inibidores potentes desta enzima podem aumentar a biodisponibilidade do itraconazol. Exemplos são: ritonavir, indinavir, claritromicina e eritromicina. O itraconazol pode inibir o metabolismo de drogas metabolizadas pela família do citocromo 3A, resultando em um aumento e/ou prolongação dos seus efeitos, inclusive seus efeitos colaterais. Após o término do tratamento, os níveis plasmáticos do itraconazol declinam gradualmente, dependendo da dose e da duração do tratamento. Este fato deve ser levado em conta quando o efeito inibitório do itraconazol sobre drogas administradas concomitantemente for considerado.